衣原体阴性说明没有这种病原体感染。 衣原体感染是由各种衣原体感染引起的感染性疾病，通常有妇科的阴道炎症、宫颈炎症，如果引起上行性感染，会导致盆腔感染性疾病，如果怀孕可能引起早产或流产。 如果因为感染去做了衣原体检测，结果报告显示阴性，说明没有衣原体的感染。通过衣原体检查可以指导临床上的用药，如果出现衣原体感染，建议尽早干预，做适当的药物治疗。如果有生育要求的，建议先进行治疗，等衣原体转为阴性再考虑备孕。
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