矮小症一般不完全是先天所致。人的身高有60%~70%的因素，取决于父母的身高。如果家里长辈的身高比较矮小，子代的身高也会受到限制，也就是先天的因素。 如果家里长辈的身高不矮，但是子代身高比较矮小，一般是由于饮食结构、生活环境、运动等生活方式有关系。如果是营养不良和情绪变化，也会影响生长发育。 还有一些患者身高变矮，是由于一些器质性的疾病所致，比如中枢系统的肿瘤和糖代谢的改变，以及心理和精神的异常等。
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