普通的急性腹泻，比如消化不良、病毒感染、细菌感染引起的腹泻，针对病因治疗能很快恢复，不需要查胃镜、肠镜。如果是反复的腹泻、腹痛，治疗效果不好，或者是好了又容易反复，怀疑是胃溃疡或者是慢性结肠炎，需要做胃镜或者肠镜。目的是明确病因，针对病因治疗，临床效果才会好。做胃肠镜，也可以看到胃和肠道有没有长肿瘤、息肉的情况。如果怀疑是胃炎，儿童可以先做一下钡餐、B超，和碳13呼气试验，看看有没有胃炎，幽门螺旋菌感染，不一定马上需要做胃镜。
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