在判定是否胚胎停育的时候，并不根据孕酮的水平来进行判定。但是胚胎停育往往孕酮水平比较低，两个之间没有很明确的因果关系。主要根据孕囊的大小和相应的孕周是否匹配，还有β-HCG 的水平上升，是否是合适的水平来判定是否胚胎停育。如果出现胚胎停育，孕酮的水平往往低于正常。在早孕期进行检查的时候，如果测定孕酮水平比较低，比如低于15ng/ml，有可能预示着胚胎本身发育的不一定是好胚胎。这个规律也并不明确,因为有些人在孕酮水平比较低的情况下，依然妊娠维持的比较好。
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