结肠镜的检查是在肠道洗干净之后，从肛门逐步进入结肠内，可以看到来源于黏膜层的病变。比如黏膜的糜烂、充血、水肿、息肉。但结肠镜检查仅能检测到来源于黏膜层的病变。对于来源于黏膜下层或者是肌层病变就难以判断。 而超声内镜是内镜前端带有超声探头，除了观察来源于黏膜的病变，还可以将超声探头放到病变部位，更好的分辨病变是来源于哪一层。
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