导致胚胎停育的原因有很多，主要包括以下这几大类：比如遗传因素，像夫妻双方任何一方染色体异常，还有胚胎染色体是否异常等。内分泌因素，女方生殖内分泌有没有问题。代谢因素，女方糖耐量、胰岛素释放有没有问题。免疫因素，男女双方封闭抗体是否异常。感染因素、解剖因素、血栓前状态评估，男方因素等。还有一些胚胎停育，原因不明，要想知道具体胚胎停育原因，需要到门诊来，夫妻双方一起过来，需要采集全面病史，针对性检查、具体分析，找出具体有哪些方面的因素，再把这些原因一一解决好之后，再备孕。
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