男性的精子是由睾丸产生，产生以后储存于附睾内，逐渐成熟通过输尿管到达前列腺精管部位，在同房过程中由尿道排出。 而尿液形成于肾脏，通过输尿管储存于膀胱内，膀胱内尿液储存足够，刺激膀胱壁而通过尿道排出尿液。精子和尿液虽有部分共同的通路，但是肾结石的部位一般位于输尿管或者肾脏，和精子形成储存的部位完全不同，男性肾结石是不会影响性功能的。 但是结石产生、排出过程中可能会出现明显疼痛不适症状，患者可能因为情绪的紧张，心理方面的恐惧感，这种心理可能对性功能会产生轻微的影响。
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