肛瘘不治疗，有可能会转癌症，但是几率很小。如果不进行治疗，瘘管反复存在，脓液反复流出，会刺激外口或者周围组织出现不典型的增生。刺激时间越长，有少数患者可能会出现癌变。肛瘘虽然是感染性的疾病，通过肛瘘简单的切开或者挂线就可以治疗。如果不治疗，长期的炎症的刺激，使管壁或者是外口发生了不典型增生，会诱发癌症。虽然说几率很低，但是如果患有肛瘘了还是应该积极进行治疗。
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