儿童类风湿性关节炎的致病机制，潜在的发病机制目前还不是很清楚，但普遍认为跟遗传有关系。可能带有遗传易感的基因位点，就比较倾向于得病。某一个基因突变后，就要得类风湿关节炎，目前还没有一对一的关系，但是认为跟遗传背景有关。儿童类风湿性关节炎中，跟成人比较相像的强制性脊柱炎，就跟HIB-27有关。很多的病都与遗传有关系，比如肺炎有的很重，有的很轻，可能就是遗传背景不一样。
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