胆总管囊肿有恶变的可能。手术越早，去除病因越早，癌变的可能性越小。手术越晚，囊肿的异常改变已经形成，已经形成癌前病变，变癌症的可能性、发生率就高。 胆总管囊肿手术后，都需要定期复查，长大后要每年复查。超过18岁，超过儿科范围，30岁、40岁甚至50岁的病人，都要定期到专科医院去复查，因为有恶变的风险。
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