艾滋病的检查可以分为两部分：首先是针对艾滋病毒的检查，包括抗体的检查，有酶联免疫分析法、化学发光法、免疫荧光法。病毒抗原的检测，有酶联法。以及病毒核酸的检测，有逆转录PCR、核酸序列依赖性扩增、分支DNA信号放大系统以及实时荧光定量PCR等等方法，以及耐药基因的检测。其次针对艾滋病毒引起的疾病进行检测，包括血细胞分析、淋巴细胞计数、血液生化功能的检测，全身各个部位的影像学检查等等。如果并发机会性感染和肿瘤，还包括相应体液或者组织标本的微生物检查以及病理活检等等。
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