包皮龟头炎的诊断需要结合患者的疾病史和患者的临床表现，结合实验室检查以及病原学和病理检查。 如念珠菌感染引起者，病变部位取材直接镜检和培养可找到念珠菌；阿米巴原虫引起者，取分泌物做涂片检查，可找到阿米巴原虫；浆细胞性龟头炎病理改变具有很高诊断价值。本病还应与药物引起的固定性药疹等疾病加以鉴别。
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