败血症时体内缩血管物质（如某些细胞因子、血小板激活因子、内皮素及腺苷等）反应性增加，由此产生血流动力学改变及肾血流量减少是败血症并发肾衰竭的原因之一。除此之外，也有非血流动力学的因素，如细菌随血液迁徙至肾脏引起肾感染，在败血症性肾衰竭患者的肾活检发现，在肾间质和肾小管腔内有微小脓肿。败血症相关肾功能损害的发生也是多因素的，如内毒血症、肾低灌流量、肾毒性物质的作用等。
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