肠重复畸形不做手术并发症就是重复畸形囊肿的增大，导致梗阻感染，导致穿孔的发生。如果做肠切除吻合，肠管的切除吻合位置吻合口狭窄和吻合口瘘可能会出现，还有做完手术以后的并发症可能是肠粘连梗阻，是很多腹腔手术里最常见的并发症。 但是对于肠重复畸形的手术的治愈率是比较有把握的，治疗效果是好的，出现并发症的几率是低的。建议还是尽早的手术，虽然也面临一些风险，但是毕竟可以治愈，而不去做这个手术，可能带来的并发症会更严重一些。
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