儿童类风湿性关节炎的病因，目前还不是特别的清楚。有学说认为与遗传有关，带有某些基因的位点，可能比较容易得类风湿性关节炎。也可能与感染或自身免疫紊乱有关系。有些患儿在得病前，有过感染，尤其是病毒感染，可能关系更密切。与免疫紊乱有关系就是自身免疫问题，产生了针对自己的抗体。
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