多囊肾的患者通常可以进行肾移植。多囊肾是引起尿毒症的主要原因，并且比例逐年增加。多囊肾患者的肾脏、肝脏等部位会长出很多的囊泡，而这些囊泡占据了肾脏大部分的空间，导致肾脏无法发挥正常的功能。 由于多囊肾不是免疫性因素引起的疾病，因此这类患者在移植后出现排斥反应的几率比较低，肾移植效果也比较好。 如果多囊肾的体积过大，甚至已经部分进入了盆腔中，这时也可以部分切除多囊肾的下极来完成移植手术。
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