慢性粒细胞白血病的治疗，主要还是靠化疗，在慢性期和加速期这两个阶段，首选的药物是酪氨酸激酶抑制剂。能够针对慢性粒细胞白血病特殊的靶点进行治疗，可以让病人达到深度分子生物学的缓解。在疾病晚期阶段，推荐的治疗是TKI联合化疗，还可以考虑进行造血干细胞移植治疗。 慢性粒细胞白血病在疾病的发展过程中，有不同的阶段，大多数病人发病的时候，都是处于慢性期。有些病人病情可以进展到加速期，乃至有一部分病人到最后会进入急变期，也就是由慢性粒细胞白血病，急变为急性白血病。
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