慢性结肠炎可以通过药物治疗或者手术治疗。慢性结肠炎首先可以采取药物保守治疗,可以应用氨基水杨酸制剂,常用的药物有柳氮磺胺吡啶、美沙拉嗪、奥沙拉嗪等药物。同时要配合糖皮质激素,通常用于对应用氨基水杨酸制剂,效果不佳时,可以结合用此药。必要时也可应用免疫抑制剂,同时结合肠道益生菌调理,肠道内的微生态环境。如果出现有肠穿孔、大出血,经过上述的内科治疗无效的,及时纠正酸碱平衡,对症营养支持治疗,再做手术。