肺炎球菌、脑膜炎的鉴别出现肺炎、中耳炎、鼻窦炎以及颅脑外伤后高烧不退，神志改变。颅内高压以及脑膜刺激征就应该考虑是肺炎球菌脑膜炎的可能。肯定还要与脑膜炎球菌、流脑杆菌、金葡菌、大肠菌、铜绿单胞等化脓性脑膜炎等相鉴别。如果脑积液，外观与细胞的数量不典型时，还要与结核性脑膜炎脑脓肿等疾病相鉴别。
