肺动脉闭锁患者的症状比较多，一般在临床上，以肺部缺血或者充血以及左心室肥厚等引起的发绀症状最为多见。患儿一般在出生后就会发现特征性的发绀症状，多表现为指甲、口唇、耳垂、鼻尖以及其他皮肤黏膜部位的严重青紫色症状，其中特别以口唇部位青紫色症状最为明显。X线检查可以发现，患儿心脏在出生之后迅速的增大，随着病情的进展，患儿心脏会逐渐发展呈靴子形状。并且会出现严重的肺部以及身体其他器官的多器官功能衰竭症状。
