高烧39℃可以通过以下方式进行处理:第一,及时口服非甾体抗炎药进行退热治疗,比如可以服用布洛芬、对乙酰氨基酚等药物。第二,可以进行物理降温,比如冰敷额头,用酒精擦拭手心、脚心、腹股沟、腋窝等部位进行退热。第三,还应该大量饮水,不仅可以及时补充因发热消耗的水分避免脱水,还可以促进新陈代谢。第四,多休息,尽量不要进行运动或者过度劳累。如果体温迟迟不降或者反复高热,应该及时前往医院进行相关检查,明确病因对症治疗。