首先肛瘘切除术一定要掌握其适应症，该方法适用于已经纤维化的低位单纯性肛瘘和低位复杂性肛瘘。该方法的优点在于可以使肛瘘得到根治，一次性将内口、外口和瘘管一并切除。但是其缺点在于创面可能会相对较大，容易引起愈合慢及瘢痕形成。同时，会导致术后疼痛较为明显。
