早晨起床后发烧的原因有以下几种:1.因为感染性原因导致的发热,比较常见的呼吸道感染、泌尿系统感染、胃肠道感染,例如感冒、急性胃肠炎、尿路感染、急性扁桃体炎等,都会引起发烧。2.可能是自我感觉发热,但测量温度并没有上升,有可能是因为植物神经功能紊乱引起,通常会伴随着失眠、心烦等症状。3.可能是代谢系统疾病或内分泌系统疾病引起,例如肾上腺皮质功能亢进、甲状腺功能亢进等,都可能会引起早晨发热的现象。