手足口病应该做以下几种检查：1.需要进行血常规的检查，以明确手足口病是否合并细菌感染。2.需要进行粪便标本、留取咽试子等病毒学检测，如果能够分离出来肠道病毒，或者是检测出阳性结果，就可以确诊为手足口病。3.如果患儿伴有抽搐、昏迷、精神烦躁等症状时，还需要进行脑脊液检查，以排除患儿是否合并脑炎。4.如果患儿出现呼吸困难、咳嗽等症状时，还需要进行胸部X光的检查，以明确是否合并肺炎。5.对于患儿伴有心慌、气短等症状时，还需要进行心肌酶谱的检查。
