形成肛瘘的原因有以下几方面：1.肛周脓肿，大多数肛瘘继发于肛周脓肿，肛周脓肿自行破溃或切开引流后形成肛瘘外口，感染处肛窦形成肛瘘内口，脓腔缩小并纤维化，致密纤维组织包绕，后期腔内上皮化形成瘘管。2.肛门直肠外伤，来自消化道的金属异物、骨性异物及肛门镜检查损伤肛管直肠，细菌侵入伤口引起肛瘘。3.结核、溃疡性结肠炎、克罗恩病等非特异性炎症也可引起肛瘘。4.其他，恶性肿瘤、糖尿病、白血病、淋巴肉芽肿等。
