肛瘘发作分为慢性发作和急性发作。慢性发作又称为慢性感染期,急性发作又称为急性感染期。慢性感染期时,因瘘管引流通畅,内口发生感染后,形成的脓液及坏死组织会沿着瘘管流向外口处,肛周就会出现很多的脓液及坏死的组织,患者会觉得肛门周围肿胀不适。急性感染期时,因瘘管引流不通畅,形成的脓液及脱落的坏死组织会在体内积存,从而导致脓肿形成,患者会出现畏寒发热的症状,肛门处还会有红、肿、热、痛的感觉。