肛瘘的主要临床表现有以下几个：第一，肛周反复流脓，周期性发作，时有时无，脓液一般比较少。第二，肛周反复肿痛，正常状态下一般不会出现疼痛症状，但当局部感染脓液积存于瘘管内时，就会出现局部胀痛，当脓液流出后，疼痛又会马上缓解。第三，肛周皮肤硬结以及肿块，大部分患者可以在肛门看到局部炎性肉芽肿的外口，还可以在肛缘摸到条索状的硬块走向肛内。第四，瘙痒，脓液的刺激会导致局部的潮湿，而引起肛门周围的瘙痒。
