克罗恩病关节炎的病因目前不明确,有可能是细菌、病毒、真菌、原虫等感染造成的。也有可能是淋巴管阻塞和淋巴细胞聚集的原因、或者是炎症循环障碍等。不过这些目前没有明确的证据,都难定论。
不过,目前已经肯定,本病患者HLA-B27抗体大多阳性,说明遗传素质是本病的致病因素。近年来,从病理形态学的多样性、病的慢性炎症特性、肉芽肿的存在。多系统损伤如关节炎、皮肤损害及免疫抑制治疗有效等方面考虑,免疫调控机制障碍也是致病的重要原因,要引起足够重视。
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