小儿房间隔缺损，主要是由于三方面的因素引起的，包括遗传因素，小儿在母体内的发育因素、环境因素。发育因素，主要是由于母亲在怀孕前三个月胚胎没有发育好导致的， 大多数小儿是由于基因遗传缺陷引起的。环境因素，包括母亲在怀孕期间感染了麻疹、流行性感冒、流行性腮腺炎、柯萨奇病毒等造成的。比如母亲接触到放射线、化学物质、服用抗癌药、抗癫痫药等也可引起。有的母亲患有糖尿病、高钙血症、苯丙酮尿症等也可引起。另外胎儿在子宫内缺氧也可以引起。
