Barrett食管的症状主要是胃食管反流及并发症所引起。典型的胃食管反流病症状为胸骨后烧灼感、胸痛、反胃或反酸，部分患者因食管狭窄或癌变出现吞咽困难。并发症包括反流性食管炎、食管狭窄、溃疡、穿孔、出血和吸入性肺炎等。
