非月经期小肚子疼可能是由于妇科疾病、胃肠道疾病、腹壁淋巴结炎或者是胃肠道神经痛等因素导致。常见的导致下腹痛的妇科疾病包括子宫体炎、附件炎、盆腔炎以及子宫内膜炎等，除去妇科炎症，子宫肌瘤、卵巢囊肿等疾病也有可能导致下腹痛，而胃肠道疾病中常见的肠炎以及较少见的溃疡性结肠炎也会伴有下腹痛的症状。除此之外，胃肠道神经痛、腹壁淋巴结炎等疾病也会出现类似症状。所以单纯凭下腹部痛的症状并不能确诊，需要通过大便常规、B超等进一步的检查才能确诊。
