经期头疼可以使用药物治疗、生活习惯的改善以及心理治疗进行综合根除。月经期间部分患者可能会出现神经系统不稳定以及头疼等症状，导致经期头疼的具体原因尚不明确，可能与经期体内雌孕激素水平降低相关。除此之外，月经来潮之前血液中的阿片肽水平明显低于正常水平，进而可能导致一些神经、精神方面的变化。月经期间的头疼一般很难根除，所以心理治疗十分重要，充足的睡眠、适当的锻炼以及清淡的饮食，也能适当地缓解疼痛。服用避孕药也能一定程度上缓解痛经，但长期服用会有一定副作用。
