肛门流脓大多是由于肛门周围化脓感染性疾病所导致的，有以下几种可能性比较常见：第一，肛周脓肿由于肛门周围各个间隙出现化脓性感染所引发，当脓肿破溃以后就会导致肛门流脓症状。第二，肛瘘。肛瘘瘘管往内连接直肠肛管，往外连接肛门周围皮肤，所以肛瘘瘘管会出现反复的感染，也会导致肛门流脓的症状。第三，肠道炎症性疾病，例如溃疡性结肠炎，当处于急性发作期时，会产生脓血便。第四，肛管或直肠恶性肿瘤。恶性肿瘤会导致局部坏死，也会引发肛门流脓症状。
